Frédéric CARVALHO

UMR 1107 INSERM/UCA Neuro-Dol
Facultés de Médecine et Pharmacie
Place Henri Dunant
63001 Clermont-Ferrand
FRANCE

Dr. Frédéric CARVALHO

Chargé de Recherche
Equipe Pharmacologie Fondamentale et Clinique de la Douleur, Équipe PFCD – Axe Métabolites Microbiens et Douleurs Chroniques

frederic.carvalho@-Code to remove to avoid SPAM-uca.fr

Thématique de Recherche:

Mon projet est focalisé sur l’étude de la physiopathologie de la douleur chronique, principalement abdominale associée au SII ou aux MICI en période de rémission, afin de déterminer les mécanismes de chronicisation de la douleur, avec un focus particulier sur l’influence des métabolites et des approches interventionnelles en modèles précliniques. Il se trouve à l’interface entre la microbiologie et les neurosciences. Ce projet se décline en deux approches : (1) Etudier l’impact du microbiote et de ses métabolites sur la douleur abdominale chronique et le « Bien-être » en privilégiant la voie AhR/IL-22 ; (2) Evaluer le pouvoir neuromodulateur de bactéries à potentiel probiotique comme F. prausnitzii ou P. distasonis.

Responsabilités:

Depuis 2013, j’ai dirigé ou co-dirigé 4 M1, 8 M2 et 7 doctorants dont 2 en cours.

10/12-12/2015 : Co-encadrement de thèse de L. BOUDIEU, financée par une bourse MENRT. Dr Boudieu est actuellement Attaché de Recherche Clinique au CHU de Clermont-Ferrand.
10/14-06/2017 : Co-encadrement de thèse de A. LASHERMES, financée par une bourse MENRT. Dr Lashermes est actuellement Cheffe de projet R&D chez Novobiome.
11/15-12/2018 : Directeur de thèse de M. DEFAYE, financée par une bourse de la région Auvergne-Rhône-Alpes (financement « Thématique Emergente »). Dr Defaye réalise actuellement un post-doctorat à l’Université de Calgary (Canada) avec le Pr Christophe ALTIER.
11/18-04/2022 : Directeur de thèse de M. MEYNIER, financée par une bourse Région/FEDER (financement CPER « Nex-N-Mob »). Dr Meynier réalise actuellement un post-doctorat dans le laboratoire du Dr Emmanuel DEVAL, Institut de Pharmacologie Moléculaire et Cellulaire (IPMC)/Université Côte d’Azur (Nice).
01/19-12/2022 : Directeur de thèse de S. GERVASON), sur financement privé (Greencell). Dr Gervason occupe actuellement un poste de Cheffe de projet R&D chez Biose Industrie. Sa thèse a été récompensée par le Grand Prix des jeunes chercheurs de la ville de Clermont-Ferrand en 2023.
Depuis 10/2021 : Directeur de thèse de V. DAUGEY, financée par une bourse MENRT.
Depuis 10/2023 : Directeur de thèse de N. VERDUIJN, financée par une bourse FRM.

Sélection d'articles récents:

Au cours de ma carrière, j’ai réalisé 40 articles (38 originaux et 2 revues) pour un total de 4790 citations et un H-index de 23. Parmi ces 40 publications, 16 sont en PDC (6 en premier auteur, 10 en dernier ou co-dernier auteur et 11 en auteur correspondant). Les publications sont disponibles sur Web of Science et ORCID (#0000-0003-1592-2369). J’ai aussi été inventeur dans le dépôt de deux brevets. De plus, j’ai donné 11 communications orales dans le cadre de congrès internationaux (dont 3 sur invitation), ainsi que 15 communications affichées sous forme de posters dans des congrès internationaux.

Meynier M, Daugey V, Mallaret G, Gervason S, Meleine M, Barbier J, Aissouni Y, Lolignier S, Bonnet M, Ardid D, De Vos WM, Van Hul M, Suenaert P, Brochot A, Cani PD, Carvalho FA. Pasteurized Akkermansia muciniphila improves irritable bowel syndrome-like symptoms and related behavioral disorders in mice. Gut Microbes. 2024 Jan-Dec; 16(1):2298026. doi: 10.1080/19490976.2023.2298026.
Gervason S, Meleine M, Lolignier S, Meynier M, Daugey V, Birer A, Aissouni Y, Berthon JY, Ardid D, Filaire E, Carvalho FA. Antihyperalgesic properties of gut microbiota: Parabacteroides distasonis as a new probiotic strategy to alleviate chronic abdominal pain. Pain. 2023 Sep 27. doi: 10.1097/j.pain.0000000000003075.
Meynier M, Baudu E, Rolhion N, Defaye M, Straube M, Daugey V, Modoux M, Wawrzyniak I, Delbac F, Villeger R, Meleine M, Nogues E, Godfraind C, Barnich N, Ardid D, Poirier P, Sokol H, Chatel JM, Langella P, Livrelli V, Bonnet M, Carvalho FA*. AhR/IL-22 pathway as new target for the treatment of post-infectious irritable bowel syndrome symptoms. Gut Microbes. 2022 Jan-Dec; 14(1):2022997. doi: 10.1080/19490976.2021.2022997.

Informations Supplémentaires:

ORCID: 0000-0003-1592-2369
LinkedIn: Frederic Carvalho

Publications HAL

Article dans une revue

2024

ref_biblio: Sandie Gervason, Mathieu Meleine, Stéphane Lolignier, Maëva Meynier, Valentine Daugey, et al.. Antihyperalgesic properties of gut microbiota: Parabacteroides distasonis as a new probiotic strategy to alleviate chronic abdominal pain. Pain, 2024, 165 (5), pp.e39-e54. ⟨10.1097/j.pain.0000000000003075⟩. ⟨hal-04316524⟩
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ref_biblio: Maëva Meynier, Valentine Daugey, Geoffroy Mallaret, Sandie Gervason, Mathieu Meleine, et al.. Pasteurized Akkermansia muciniphila improves irritable bowel syndrome-like symptoms and related behavioral disorders in mice. Gut microbes, 2024, 16 (1), pp.2298026. ⟨10.1080/19490976.2023.2298026⟩. ⟨hal-04371864⟩
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ref_biblio: Fabien Rondepierre, Maëva Meynier, Johan Gagniere, Vincent Deneuvy, Anissa Deneuvy, et al.. Preclinical and clinical evidence of the association of colibactin-producing Escherichia coli with anxiety and depression in colon cancer. World Journal of Gastroenterology, 2024, 30 (21), pp.2817-2826. ⟨10.3748/wjg.v30.i21.2817⟩. ⟨hal-04601735⟩
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2023

ref_biblio: Célia Chamignon, Geoffroy Mallaret, Julie Riviere, Marthe Vilotte, Sead Chadi, et al.. Beneficial Effects of Lactobacilli Species on Intestinal Homeostasis in Low-Grade Inflammation and Stress Rodent Models and Their Implication in the Modulation of the Adhesive Junctional Complex. Biomolecules, 2023, 13 (9), pp.1295. ⟨10.3390/biom13091295⟩. ⟨hal-04538013⟩
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ref_biblio: Sandie Gervason, Mathieu Meleine, Stéphane Lolignier, Maëva Meynier, Valentine Daugey, et al.. Antihyperalgesic properties of gut microbiota: Parabacteroides distasonis as a new probiotic strategy to alleviate chronic abdominal pain. Pain, 2023, ⟨10.1097/j.pain.0000000000003075⟩. ⟨hal-04687346⟩
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ref_biblio: Flore Maillard, Maëva Meynier, Stanislas Mondot, Frederic Pepke, Chloé Galbert, et al.. From In Vitro to In Vivo: A Rational Flowchart for the Selection and Characterization of Candidate Probiotic Strains in Intestinal Disorders. Microorganisms, 2023, 11 (4), pp.906. ⟨10.3390/microorganisms11040906⟩. ⟨hal-04057783⟩
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2022

ref_biblio: Geoffroy Mallaret, Amandine Lashermes, Mathieu Meleine, Ludivine Boudieu, Julie Barbier, et al.. Involvement of toll-like receptor 5 on mouse model of colonic hypersensitivity induced by neonatal maternal separation. World Journal of Gastroenterology, 2022, 28 (29), pp.3903-3916. ⟨10.3748/wjg.v28.i29.3903⟩. ⟨hal-03987265⟩
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ref_biblio: Maëva Meynier, Elodie Baudu, Nathalie Rolhion, Manon Defaye, Marjolène Straube, et al.. AhR/IL-22 pathway as new target for the treatment of post-infectious irritable bowel syndrome symptoms. Gut microbes, 2022, 14 (1), pp.1-21. ⟨10.1080/19490976.2021.2022997⟩. ⟨hal-03555153⟩
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2021

ref_biblio: S. Gervason, M. Defaye, D. Ardid, J.-Y. Berthon, C. Altier, et al.. Influence du microbiote sur la douleur. Douleur et Analgésie, 2021, 34 (2), pp.86-96. ⟨10.3166/dea-2021-0144⟩. ⟨hal-03516892⟩
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ref_biblio: A.M. Hamieh, G. Mallaret, M. Meleine, A. Lashermes, S. Roumeau, et al.. Toll-like receptor 5 knock-out mice exhibit a specific low level of anxiety. Brain, Behavior, and Immunity, 2021, 93, pp.226-237. ⟨10.1016/j.bbi.2021.01.020⟩. ⟨hal-03516251⟩
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2020

ref_biblio: Tanguy Chaumette, Lauriane Delay, Julie Barbier, Ludivine Boudieu, Youssef Aissouni, et al.. c-Jun/p38MAPK/ASIC3 pathways specifically activated by nerve growth factor through TrkA are crucial for mechanical allodynia development. Pain, 2020, pp.1. ⟨10.1097/j.pain.0000000000001808⟩. ⟨hal-02464551⟩
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ref_biblio: Manon Defaye, Céline Nourrisson, Elodie Baudu, Amandine Lashermes, Maeva Meynier, et al.. Fecal dysbiosis associated with colonic hypersensitivity and behavioral alterations in chronically Blastocystis-infected rats. Scientific Reports, 2020, 10 (1), pp.9146. ⟨10.1038/s41598-020-66156-w⟩. ⟨inserm-02884871⟩
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ref_biblio: Manon Defaye, Sandie Gervason, Christophe Altier, Jean-Yves Berthon, Denis Ardid, et al.. Microbiota: a novel regulator of pain. Journal of Neural Transmission, 2020, 127 (4), pp.445-465. ⟨10.1007/s00702-019-02083-z⟩. ⟨hal-03036258⟩
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2019

ref_biblio: Ludivine Boudieu, Sarah Mountadem, Amandine Lashermes, Mathieu Meleine, Lauriane Ulmann, et al.. Blocking α2δ-1 Subunit Reduces Bladder Hypersensitivity and Inflammation in a Cystitis Mouse Model by Decreasing NF-kB Pathway Activation. Frontiers in Pharmacology, 2019, 10, pp.133. ⟨10.3389/fphar.2019.00133⟩. ⟨hal-02324745⟩
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ref_biblio: Elodie Picard, Frédéric Antonio Carvalho, Francina Agosti, Emmanuel Bourinet, Denis Ardid, et al.. Inhibition of Cav3.2 calcium channels: A new target for colonic hypersensitivity associated with low‐grade inflammation. British Journal of Pharmacology, 2019, 176 (7), pp.950-963. ⟨10.1111/bph.14608⟩. ⟨hal-04317223⟩
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2018

ref_biblio: Manon Defaye, Céline Nourrisson, Elodie Baudu, Ivan Warwzyniak, Virginie Bonnin, et al.. Efficient and reproducible experimental infections of rats with Blastocystis spp.. PLoS ONE, 2018, 13 (11), pp.1-15. ⟨10.1371/journal.pone.0207669⟩. ⟨hal-01931278⟩
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2017

ref_biblio: Amandine Lashermes, Ludivine Boudieu, Julie Barbier, Benoit Sion, Agathe Gelot, et al.. Adherent-Invasive E. coli enhances colonic hypersensitivity and P2X receptors expression during post-infectious period. Gut microbes, 2017, 9 (1), pp.26-37. ⟨10.1080/19490976.2017.1361091⟩. ⟨hal-04317240⟩
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2016

ref_biblio: Mathieu Meleine, Ludivine Boudieu, Agathe Gelot, Emilie Muller, Amandine Lashermes, et al.. Comparative effects of alpha 2 delta-1 ligands in mouse models of colonic hypersensitivity. World Journal of Gastroenterology, 2016, 22 (31), pp.7111-7123. ⟨10.3748/wjg.v22.i31.7111⟩. ⟨hal-02636301⟩
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ref_biblio: J. Scanzi, A. Accarie, E. Muller, Bruno Pereira, Y. Aissouni, et al.. Colonic overexpression of the T‐type calcium channel Cav 3.2 in a mouse model of visceral hypersensitivity and in irritable bowel syndrome patients. Neurogastroenterology & Motility, 2016, 28 (11), pp.1632-1640. ⟨10.1111/nmo.12860⟩. ⟨hal-04317301⟩
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2015

ref_biblio: S. Miquel, R. Martín, A. Lashermes, Marion Gillet, M. Meleine, et al.. Anti-nociceptive effect of Faecalibacterium prausnitzii in non-inflammatory IBS-like models. Scientific Reports, 2015, 6, pp.19399. ⟨10.1038/srep19399⟩. ⟨hal-01263911⟩
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ref_biblio: Vishal Singh, Beng San Yeoh, Frédéric Antonio Carvalho, Andrew T Gewirtz, Matam Vijay-Kumar. Proneness of TLR5 deficient mice to develop colitis is microbiota dependent. Gut microbes, 2015, 6 (4), pp.279-283. ⟨10.1080/19490976.2015.1060390⟩. ⟨hal-03516833⟩
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2014

ref_biblio: Benoit Chassaing, Omry Koren, Frédéric Antonio Carvalho, Ruth Ley, Andrew Gewirtz. AIEC pathobiont instigates chronic colitis in susceptible hosts by altering microbiota composition. Gut, 2014, 63 (7), pp.1069-1080. ⟨10.1136/GUTJNL-2013-304909⟩. ⟨hal-03516826⟩
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ref_biblio: Jason z. Oh, Rajesh Ravindran, Benoit Chassaing, Frédéric Antonio Carvalho, Mohan s. Maddur, et al.. TLR5-Mediated Sensing of Gut Microbiota Is Necessary for Antibody Responses to Seasonal Influenza Vaccination. Immunity, 2014, 41 (3), pp.478-492. ⟨10.1016/J.IMMUNI.2014.08.009⟩. ⟨hal-03516795⟩
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ref_biblio: Jennifer Raisch, Adeline Sivignon, Benoit Chassaing, Pierre Lapaquette, Sylvie Miquel, et al.. In Memoriam, Arlette Darfeuille-Michaud, PhD. Gastroenterology, 2014, 147 (5), pp.943-944. ⟨10.1136/gutjnl-2014-308182⟩. ⟨hal-01951060⟩
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2013

ref_biblio: Malin Johansson, Jenny Gustafsson, Jessica Holmén-Larsson, Karolina Jabbar, Lijun Xia, et al.. Bacteria penetrate the normally impenetrable inner colon mucus layer in both murine colitis models and patients with ulcerative colitis. Gut, 2013, 63 (2), pp.281-291. ⟨10.1136/GUTJNL-2012-303207⟩. ⟨hal-03516824⟩
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2012

ref_biblio: Frederic A. Carvalho, Omry Koren, Julia K. Goodrich, Malin E. V. Johansson, Ilke Nalbantoglu, et al.. Transient Inability to Manage Proteobacteria Promotes Chronic Gut Inflammation in TLR5-Deficient Mice. Cell Host and Microbe, 2012, 12 (2), pp.139 – 152. ⟨10.1016/j.chom.2012.07.004⟩. ⟨hal-02652647⟩
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ref_biblio: F. A. Carvalho, I. Nalbantoglu, J. D. Aitken, R. Uchiyama, Y. Su, et al.. Cytosolic flagellin receptor NLRC4 protects mice against mucosal and systemic challenges. Mucosal Immunology, 2012, 5 (3), pp.288 – 298. ⟨10.1038/mi.2012.8⟩. ⟨hal-02648191⟩
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ref_biblio: Frédéric Antonio Carvalho, Ilke Nalbantoglu, Sophie Ortega-Fernandez, Jesse Aitken, Yueju Su, et al.. Interleukin-1β (IL-1β) promotes susceptibility of Toll-like receptor 5 (TLR5) deficient mice to colitis. Gut, 2012, 61 (3), pp.373-384. ⟨10.1136/GUT.2011.240556⟩. ⟨hal-03516776⟩
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ref_biblio: Frédéric Antonio Carvalho, Jesse Aitken, Matam Vijay-Kumar, Andrew Gewirtz. Toll-Like Receptor–Gut Microbiota Interactions: Perturb at Your Own Risk!. Annual Review of Physiology, 2012, 74 (1), pp.177-198. ⟨10.1146/ANNUREV-PHYSIOL-020911-153330⟩. ⟨hal-03516778⟩
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ref_biblio: Gayathri Srinivasan, Jesse Aitken, Benyue Zhang, Frédéric Antonio Carvalho, Benoit Chassaing, et al.. Lipocalin 2 Deficiency Dysregulates Iron Homeostasis and Exacerbates Endotoxin-Induced Sepsis. Journal of Immunology, 2012, 189 (4), pp.1911-1919. ⟨10.4049/JIMMUNOL.1200892⟩. ⟨hal-03516789⟩
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2011

ref_biblio: Frédéric Antonio Carvalho, J Aitken, A Gewirtz, M Vijay-Kumar. TLR5 activation induces secretory interleukin-1 receptor antagonist (sIL-1Ra) and reduces inflammasome-associated tissue damage. Mucosal Immunology, 2011, 4 (1), pp.102-111. ⟨10.1038/MI.2010.57⟩. ⟨hal-03516764⟩
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ref_biblio: Matam Vijay-Kumar, Jesse Aitken, Frédéric Antonio Carvalho, Thomas Ziegler, Andrew Gewirtz, et al.. Loss of function mutation in toll-like receptor-4 does not offer protection against obesity and insulin resistance induced by a diet high in trans fat in mice. Journal of Inflammation, 2011, 8 (1), pp.2. ⟨10.1186/1476-9255-8-2⟩. ⟨hal-03516761⟩
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2010

ref_biblio: Matam Vijay-Kumar, Jesse Aitken, Frédéric Antonio Carvalho, Tyler Cullender, Simon Mwangi, et al.. Metabolic Syndrome and Altered Gut Microbiota in Mice Lacking Toll-Like Receptor 5. Science, 2010, 328 (5975), pp.228-231. ⟨10.1126/SCIENCE.1179721⟩. ⟨hal-03516756⟩
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ref_biblio: Matam Vijay-Kumar, Frédéric Antonio Carvalho, Jesse Aitken, Nimita Fifadara, Andrew Gewirtz. TLR5 or NLRC4 is necessary and sufficient for promotion of humoral immunity by flagellin. European Journal of Immunology, 2010, 40 (12), pp.3528-3534. ⟨10.1002/EJI.201040421⟩. ⟨hal-03516759⟩
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2009

ref_biblio: Frédéric A Carvalho, Nicolas Barnich, Adeline Sivignon, Claude Darcha, Carlos H F Chan, et al.. Crohn’s disease adherent-invasive Escherichia coli colonize and induce strong gut inflammation in transgenic mice expressing human CEACAM. Journal of Experimental Medicine, 2009, 206 (10), pp.2179 – 2189. ⟨10.1084/jem.20090741⟩. ⟨hal-01931313⟩
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2008

ref_biblio: Frédéric Antonio Carvalho, Nicolas Barnich, Pierre Sauvanet, Claude Darcha, Agathe Gelot, et al.. Crohnʼs disease-associated Escherichia coli LF82 aggravates colitis in injured mouse colon via signaling by flagellin. Inflammatory Bowel Diseases, 2008, 14 (8), pp.1051-1060. ⟨10.1002/IBD.20423⟩. ⟨hal-03516742⟩
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2007

ref_biblio: Nicolas Barnich, Frederic A. Carvalho, Anne-Lise Glasser, Claude Darcha, Peter Jantscheff, et al.. CEACAM6 acts as a receptor for adherent-invasive E. coli, supporting ileal mucosa colonization in Crohn disease. Journal of Clinical Investigation, 2007, 117 (6), pp.1566-1574. ⟨10.1172/JCI30504⟩. ⟨hal-02666899⟩
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ref_biblio: Nathalie Rolhion, Frédéric Antonio Carvalho, Arlette Darfeuille-Michaud. OmpC and the sigma(E) regulatory pathway are involved in adhesion and invasion of the Crohn’s disease-associated Escherichia coli strain LF82. Molecular Microbiology, 2007, 63 (6), pp.1684-1700. ⟨10.1111/j.1365-2958.2007.05638.x⟩. ⟨hal-02662000⟩
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2006

ref_biblio: J. Delmas, F. Robin, Frédéric Antonio Carvalho, C. Mongaret, R. Bonnet. Prediction of the Evolution of Ceftazidime Resistance in Extended-Spectrum β-Lactamase CTX-M-9. Antimicrobial Agents and Chemotherapy, 2006, 50 (2), pp.731-738. ⟨10.1128/AAC.50.2.731-738.2006⟩. ⟨hal-03516705⟩
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Communication dans un congrès

2020

ref_biblio: Maeva Meynier, Elodie Baudu, Manon Defaye, Y Wawzyniak, Frederic Delbac, et al.. The IL-22 pathway as target to relieve visceral pain and animal well-being. ICTRHN, Jun 2020, Clermont-Ferrand, France. ⟨hal-02524613⟩
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ref_biblio: Maeva Meynier, Elodie Baudu, Nicolas Barnich, Denis Ardid, Jean-Marc Chatel, et al.. Tryptophan derivatives effects via the AhR signaling pathway modulation on host disturbances after a Citrobacter rodentium infection. CELL SYMPOSIA, May 2020, PARIS, France. ⟨hal-03045712⟩
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2019

ref_biblio: Frédéric Antonio Carvalho. Microbiote et sensibilité intestinale. Journée Probiotiques & microbiote intestinal, Feb 2019, lyon, France. ⟨hal-02363999⟩
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Brevet

2014

ref_biblio: Muriel Thomas, Philippe P. Langella, Luis Bermúdez-Humarán, Harry Sokol, Sylvie Miquel, et al.. Faecalibacterium prausnitzii strains for treating and preventing gastrointestinal pain. France, Patent n° : 14306803.9. 2014. ⟨hal-04292693⟩
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Poster de conférence

2021

ref_biblio: Delanne Améline, Jérémy Denizot, Ghislain Garrait, Khaled Fadhlaoui, Arthur Chevet, et al.. Development of a vector based on natural excipient in order to reduce the therapeutic doses of current treatments and their adverse effects in chronic inflammatory bowel diseases (IBD).. Young Researchers of Auvergne Rhône Alpes Region Congress, Jun 2021, Virtual conference, France. ⟨hal-03417146⟩
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ref_biblio: Sandie Gervason, Edith Filaire, Mathieu Meleine, Denis Ardid, Jean-Yves Berthon, et al.. Strict anaerobic bacteria involvement in gut-brain axis: A novel regulator of visceral pain and well-being. Federation of Neurgastroenterology & Motility, Apr 2021, adélaïde, Australia. 32, 2020. ⟨hal-03038507⟩
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2020

ref_biblio: Maeva Meynier, Elodie Baudu, Nicolas Barnich, Denis Ardid, J.M. Chatel, et al.. Effects of tryptophan derivatives via the AHR/Il22 signaling pathway modulation on host disturbances in post citrobacter rodentium infection model mimicking irritable bowel syndrome. UEGW 2020, Oct 2020, AMSTERDAM, Netherlands. ⟨hal-03046872⟩
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2015

ref_biblio: F. Carvalho, A. Lashermes, S. Miquel, Rebeca Martin Rosique, A. Gelor, et al.. Impact of intestinal dysbiosis on mouse models of colonic hypersensitivity. NeuroGASTRO 2015, Jun 2015, Istanbul, Turkey. John Wiley and Sons, Neurogastroenterology and Motility, 27 (Suppl. S2), 2015, Neurogastroenterology and Motility. ⟨hal-01535295⟩
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